قابلیت های کلیدی نرم افزار ChemOffice Professional:
- رسم مولکول ها، واکنش ها و نهادهای بیولوژیکی برای استفاده در اسناد الکترونیکی
- امکان جستجو در نرم افزار با ابزار SciFinder
- مرتب سازی، تجزیه و تحلیل و سازماندهی مجموعه از ترکیبات و داده ها و کشف روابط ساختار فعالیتی و اثرات
- ارائه زبان برنامه نویسی ChemScript برای دستکاری ساختار و فرآیند های شیمیایی/بیولوژیکی
- ابزار Chem3D برای تولید مدل های سه بعدی از ساختارهای مولکولی
- ابزارهای حرفه ای در ذخیره سازی و بازیابی اطلاعات و داده های ساختار های شمیایی
- و ...